Yem ve gübre depolama tesislerinin çevresel etkilerini en aza indirmek için, atık yönetimi, su kaynaklarının korunması, hava kirliliği kontrolü ve doğal yaşam alanlarının korunması gibi önlemler alınmalıdır. Ayrıca, çevre dostu teknolojilerin kullanımı da çevresel etkileri azaltmada etkili olabilir.